Yayasan Mercy Indonesia saat ini memiliki 7 panti asuhan yang tersebar di seluruh Indonesia, antara lain di Atambua, Denpasar, Rote, Soe, Waikabubak dan Wamena. Panti Asuhan Mercy Atambua merupakan panti asuhan pertama yang didirikan.

Kami juga mendirikan 4 Children Center yang tersebar di beberapa wilayah di Indonesia yaitu di Kaliwesi, Medan, Nias dan Sorong. Kami berfokus pada pertumbuhan fisik, emosional, akademik, dan spiritual yang dibutuhkan anak-anak.

Program tambahan Mercy Indonesia antara lain ABH, sebuah layanan yang menangani anak-anak yang bermasalah dengan hukum berdasarkan keputusan pengadilan. Program ABH bertujuan untuk memberikan pengembangan keterampilan dan bimbingan spiritual kepada anak-anak yang bermasalah dengan hukum.

Salah satu program unggulan Yayasan Mercy Indonesia adalah Program Bedah Gereja. Melalui pelayanan ini, kami mampu membangun dan merenovasi gedung gereja di daerah terpencil atau pedesaan. Gereja-gereja yang dibantu melalui program ini adalah gereja-gereja yang bangunannya rusak, tidak layak atau bangunan yang roboh akibat bencana alam. Hingga saat ini, lebih dari 30 gedung gereja yang telah dibantu melalui Program Bedah Gereja Yayasan Mercy Indonesia.

Pelayanan Lapas kami berisi program sekolah di Lapas Pria dan Wanita di Kerobokan Bali, untuk memberikan pengembangan karakter bagi para narapidana.

Membantu penderita kusta membangun sekolah PAUD, gereja dan air bersih di desa Poguwatu, Sumba Tengah.

Kami mendorong Anda untuk datang mengunjungi proyek kami di Indonesia dengan program perjalanan misi kami setiap tahun. Anda dapat melihat kehidupan anak-anak dan berbagi dengan mereka, Anda juga akan mendapatkan pengalaman yang mengubah hidup.

Kami melakukan kampanye untuk membantu anak-anak melalui pemberian seperti bingkisan natal atau bingkisan sekolah untuk anak-anak yatim piatu di Indonesia setiap tahun.

Salah satu Program kami adalah Mercy Peduli Korban Bencana. Pada tahun 2018, kami membantu masyarakat dan anak-anak korban gempa dan tsunami di Palu, Provinsi Sulawesi Tengah.